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La SFBI a pour but principal de promouvoir les recherches interdisciplinaires autour de la Biologie, de l'Informatique, des Mathématiques et de la Physique.
Elle a pour principaux objectifs :
de réunir les chercheurs de l'espace francophone afin de coordonner et faciliter la recherche, la communication et la collaboration scientifique avec toutes les personnes intéressées par la bioinformatique ;
d'améliorer la visibilité de la bioinformatique auprès des institutions et des médias et de diffuser les appels d'offre contractuels ;
de diffuser des informations sur l'enseignement de la bioinformatique, sur les possibilités de stages et de recrutement,
de faciliter l'organisation de rencontres nationales et internationales ou toute manifestation scientifique en rapport avec la bioinformatique, en particulier de susciter et de choisir les candidats à l'organisation du colloque JOBIM ;
d'aider à la diffusion de publications et de logiciels relevant du domaine.
